Zadania w zakresie badań nad gospodarką morską realizowane przez Centrum obejmują w szczególności: budowanie świadomości społecznej w zakresie znaczenia gospodarki morskiej w regionie i kraju; promocję i upowszechnienie wiedzy na temat gospodarki morskiej; współpracę z podmiotami zewnętrznymi, w tym administracją oraz przedsiębiorcami; koordynowanie i wspieranie przedsięwzięć badawczo-rozwojowych oraz wdrożeniowych i popularyzatorskich; międzywydziałową współpracę w zakresie pozyskiwania oraz realizacji projektów i grantów związanych z gospodarką morską, w tym z udziałem otoczenia społeczno-gospodarczego; koordynowanie współpracy z otoczeniem społeczno-gospodarczym w zakresie realizacji celów badań nad gospodarką morską oraz wspólnych projektów badawczo-rozwojowych i edukacyjnych, w tym szkoleniowych; organizowanie i prowadzenie studiów podyplomowych, staży, szkoleń i kursów związanych z gospodarką morską; współpracę międzynarodową; organizację konferencji i seminariów.